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托勒密中，眾人進行最後探討後，準備將外宇宙用母艦－天人轉交給了人類，至于轉移位置的問題就交給政府了，但是在確定新政府是否能夠使人類和平相處之前，這艘母艦是不會交給人類的。
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數天後，新的政府總統出現，一連串政策和改變使得世界煥然一新，信息的公開使得世界了解了一切真相，連續觀察一個月後，在天人確定新政府可以履行和平計劃的同時，宇宙戰艦的數據和其本身也被交給了新政府。
與此同時，沙慈和路易斯被轉移到了新政府的中央醫院中進行進一步治療，而在最後一戰中被帶走的安德烈也終于原諒他的父親並和他的父親，謝爾蓋，一同回到了地球。當然，還有一同被帶回來的格拉漢姆，說起來，格拉漢姆重新認識自我後也恢復了生存下去的動力，同畢利一起被送回了政府。畢利在離開前可是十分希望留在皇身邊，但是被皇勸說後回到了地球。
阿雷路亞和瑪麗為了贖罪決定去地球四處旅行了，尼爾和萊爾祭拜一下自己的親人後回到了天人，萊爾已經徹底脫離了卡塔隆，真正的成為了天人的一員，並和艾紐舉辦了婚禮，一同舉辦的還有里西典達爾和克里斯汀。當然，阿雷路亞和瑪麗還沒有結婚的準備，兩人覺得自己的罪還沒有還清，在還清前兩人不打算結婚。
說起來，妮娜也來到了天人，當時得知妮娜沒有被路易斯殺死反而被帶回來了的事，驚呆李戰和李戰的小伙伴們，最後李戰不得不感慨伊歐利亞的洗腦能力，並自此下定決心以後所有溝通的活全部交給伊歐利亞。
不過妮娜也被好好教育一番，現在她已經是重新做人了，而且在得知自己的仇人——薩謝斯被尼爾和萊爾兩兄弟殺死後，妮娜對尼爾兄弟二人的態度頓時變得非常好，當然再好也沒有剎那好就是了。
王留美也將王家交給了一個值得信賴的變革者就賴在托勒密中，呃，準確的是賴在了李戰身旁。
剎那在此期間也回到了地球和瑪麗娜見了一面，雖然還是沒有什麼實質性的進展。
得到伊歐利亞新技術和Veda的新資料的天人，很快就派飛船去木星制造新的太陽爐了，同時00－Q高達也開始準備在那期間制造，而天人的基地中則制造其他人的高達還有裝備。
伊歐利亞被天人殖民衛星中的人接受，眾人也好好在衛星中休息的很久。
之後就是一陣平靜，李戰開始做著超長距離跳躍準備，火星基地的資源全部轉移到跨星系超長距離跳躍門的建設上了，但即使如此，建造完成也需要兩年的時間，正好這期間可以等到木星的外星生物到來，而且也可以在此期間查查之前亂入的詳細情況。
此後，兩年，相安無事，直到木星探測器返回地球的那一刻……
“剎那去解決衛星公社的問題了啊，真無聊啊。”李戰喝著果汁，無趣地靠著副手椅上。
“妮娜看到了，李戰又偷懶。”妮娜那個妮子來到了艦橋，一眼就瞅到正在悠閑著的李戰。
“切，被發現了……”李戰咂咂嘴。
“話說，剎那什麼時候回來？”妮娜著急地問道。
“啊~~我說你也太著急了吧，離預定匯合時間還有兩分鐘呢。”李戰戲謔地看著妮娜。
“哼，我們可是戀人。”妮娜一挺胸道。
“瑪麗娜對他的吸引力可是比你強，還有，剎那也沒承認和你之間的關系吧。”李戰調侃地搖著手指。
“可，可惡！！”
妮娜頓時發怒了，沖了上來，不過李戰一個彈指神功便彈中妮娜的額頭。少女立刻沿反方向飄了出去，同時還痛苦地捂著額頭。
“你這個混蛋，總是彈額頭，很疼的哎！”妮娜揉了揉，然後才瞪著眼楮看李戰。
“這可傷腦筋了，難道要讓我用敲的？”說著李戰還摸了摸拳頭。
“唔！”妮娜頓時語塞了。
周圍幾人也是忍俊不禁。
“檢測到剎那的Flag信號，第一格納庫閘門打開，Flag回收開始。”菲露特的報告打斷了兩人的玩鬧。
“哦~回來了，嘛，向我證明你們是戀人吧。”李戰再次戲謔地看著妮娜。
“你，你欺負人，皇，你看看他！！”妮娜頓時眼紅紅地拉著皇的手。
“好啦好啦，李戰只是在和你開玩笑呢。”皇無奈地安慰了妮娜幾下，同時也瞪了李戰一眼，不過李戰倒是無所謂地聳了聳肩。
不多時，剎那就來到了艦橋，然後就開始一本正經地報告著，連看都沒看旁邊獻媚的妮娜。
“哈~~”正當李戰听得要睡著的時候，菲露特突然出聲了︰“Veda傳來定期報告，聯邦軍正在對飛往地球的探測船進行拆除作業。”
李戰的眼楮突然一亮，剎那也是有所感覺似得，兩人對視了一眼。
拉瑟疑惑地重復了一句，“對探測船進行拆除作業？”
皇注意到李戰和剎那的舉動，頓時覺得似乎這件事不簡單，便又問道︰“能查到從哪里來的嗎？”
“是。”菲露特回答完立刻開始了調查。
“木星。”
剎那看著李戰，李戰點點頭，隨即便追問菲露特，“那艘船的詳細資料能查到嗎？”
“我試試。”
艦橋中的幾人立刻注意到兩人的變化，妮娜也不再撒嬌，安靜地等待著結果。
拉瑟最心急，率先問道︰“有什麼問題嗎？”
剎那一頓，再次看向李戰，良久，才又說道︰“查到的話，通知我。”隨後，剎那就離開了艦橋。
皇一看剎那走了便轉而問向李戰，“李戰，你也是純種變革者，是不是感應到什麼事了？”
“準確的說，感覺很奇怪，當然，由于太微弱了也許是錯覺，所以剎那才沒有對大家說。”李戰也有那股不舒服的感覺，因此說道。
“原來如此，怪不得剎那不說呢……”妮娜恍然大悟地一錘手。
“好了，聯邦軍什麼時候執行拆除作業？”李戰問道。
“七個小時後。”菲露特回答道。
“是嗎，七個小時後，我再回來，到時候直播報告就拜托了，菲露特。”李戰站起身。
“明，明白。”菲露特臉微紅。
李戰走後，妮娜立刻趴在菲露特的身後蹭著菲露特的臉，“啊~~菲露特醬臉紅了，臉紅的菲露特醬好可愛啊。”說著，還一臉陶醉樣。
“話說，老伊頭，你怎麼還在這賴著啊？去火星不是更好嗎？”剛回到自己房間，李戰就看到等候多時的伊歐利亞。
“切，要不是有事，你以為我會來，還有火星一點也不好！！”伊歐利亞嘴一撇，將一組數據交給了李戰，隨後便離開了。
李戰接過來立刻便翻看起來，也沒有管伊歐利亞的離開。
“這是！！”
李戰將紙制資料燒至一空，雙手頓時緊緊地握住了，“生命的……毀滅者嗎……”
七個小時後，艦橋內，菲露特開始直播聯邦軍的拆除作業。
“宇宙時1747，聯邦軍三艘巡洋艦進入攻擊軌道，開始發射導彈，數量120枚，第一輪全彈命中，探測艦偏移率……”
李戰十分干脆的接口道，“失敗了。”
“呃，沒錯，不到20%”菲露特轉過頭來看著在指揮椅後的李戰。
“你是怎麼知道的。”拉瑟差異地看著李戰，旁邊的艾紐倒是有些理解。
“有這種感覺，硬要說是什麼的話，那就是潛意識吧。”李戰也有些不確定地說道，說到底，李戰還是搞不明白這種神神秘秘的東西是什麼，就像是精神力，知道怎麼用怎麼恢復，但是不知道是怎麼產生的，究竟為什麼會有，雖然有神族的解釋，但是李戰還是理解不能。
“潛意識……嗎……”皇喃喃道。
“聯邦軍出動變革者專用機體，加迪拉薩，巡洋艦仍在進行攻擊，但是效果不明顯……專用機抵達預定坐標，gn毒牙全部釋放，探測艦艦體分解，gn破壞炮發動，探測艦爆炸……預計碎片全部會燃燒殆盡。”
菲露特明顯松了一口氣，但是李戰卻不那麼認為︰“恐怕不會這麼簡單。”
“難道？”艦橋內的幾人頓時一驚。
“不知道，有消息後告訴我和剎那。”李戰皺皺眉也離開了艦橋。
幾個小時後，地球發生了一系列的襲擊事件，李戰、剎那、尼爾和萊爾也被叫到了艦橋。
當得知這些消息後，剎那率先開口，“降落地球。”
萊爾反對道，“哈？只不過是奇怪的事件而已吧。”
剎那想要反駁，但是不知道該如何說了，“不對。”
“根據情報，所有受傷的人都是腦量子波高的人，也就是說即將成為變革者的人。”皇解釋道。
“沒錯，這可不僅僅是簡單的事件，也許是外星人哦，大怪物，哇！！！”李戰突然扮鬼臉從菲露特身後嗖的一下出現。
“啊！！”菲露特嚇了一跳。
“討厭，李戰！”菲露特一看是李戰，立刻一擊粉拳將李戰大飛。
“啊，玩笑開不得啊。”李戰蹲在角落里無聲地畫著圈圈。
“如果是這樣的話，伙伴會有危險。”剎那皺眉道。
“米蕾娜，聯系阿雷路亞。”皇反應迅速地說道。
“是。”
“準備小艇。”剎那突然說道。
“好吧，我陪你，剎那。”萊爾和尼爾兩兄弟無奈地說道。
“不行，聯系不上。”米蕾娜突然焦急地喊道。
“趕緊。”剎那眼神一凝，立刻向門口加速。
“小心。”臨走前，剎那和李戰對視了一眼，李戰用眼神示意到。
“我明白。”剎那一點頭。
數小時後，作戰會議室中，菲露特和米蕾娜還有李戰等待著幾人的回歸……
艙門很快就打開了，阿雷路亞和瑪麗率先飄了進來。
“哈普提森先生，比利斯小姐，好久不見。”米蕾娜張開雙手迎接道。
“變化很大呢，米蕾娜。”阿雷路亞笑道。
“這發型相當適合你呢。”瑪麗也夸獎道。
“正向成年女性蛻變中。”米蕾娜得到兩人的夸獎，開心地眯著眼楮。
“菲露特也是。”阿雷路亞再次說道。
“啊，嗯。”菲露特也是微微一笑。
話說起來，菲露特和米蕾娜兩個人都換發型了，米蕾娜換成了那種，呃，似乎是曲卷發吧。（啊，反正就是那樣啦）菲露特由于听到了李戰的長發最好的發言後，立刻把剪短的決定拋棄了，換成了非常有古典美的披發。
“剎那，怎麼樣？”李戰問道。
“應該是……”
兩人一同點頭了，其他人一頭霧水，這時候皇來了，“剎那，克洛斯羅德他們呢？”
“聯邦政府安排他們去腦量子波阻斷設施避難了。”剎那這才轉過身來對著正在向這邊移動的皇說道。
“不愧是新政府，明智的判斷。”皇停在了剎那面前。
“先前拜托的事……”剎那再次發言。
“關于那件事……”皇猶豫地看著剎那。
“先讓我們喘口氣吧。”萊爾突然打斷了皇的繼續。
尼爾也是贊同地點著頭，“說起來，一去一回的，好累啊。”
“也是啊，那麼00:12在會議室集合。”皇也松口氣，道。
“阿雷路亞你們先去休息吧，房間還保持原樣。”拉瑟走到門口，對著里面的阿雷路亞兩人說道。
“謝謝，瑪麗，走吧。”阿雷路亞領著瑪麗準備離開。
“我帶路。”米蕾娜立刻走在最前面，臨走前還對剩下的菲露特告別︰“菲露特，稍後見。”
“嗯。”菲露特笑著告別完後，便擔憂地看著李戰。
“剎那，你也感覺到了吧。”李戰這時從房間內走出，走到了剎那的身旁。
“啊，感覺到了，那不祥的預感。”剎那握緊拳頭。
“你們感覺到什麼了嗎？”菲露特擔憂地問道。
“啊，是有什麼東西，但是說不清啊。”李戰胡亂地撓著頭，雖然很清楚是外星生命體，但是李戰可不想提前告訴別人，而且光憑借變革者的能力確實感覺不出是什麼，所以這麼說也不算錯。
很快兩人便回到了各自的房間……（其實我很吐槽，電影中，這段里，在剎那回憶之前桌上的花不見了，出現那個被打死的形似李瘋子的人後，花就出現了，好詭異啊。）
作戰會議室中，眾人再次集結一起，皇立刻向眾人說起剎那的事件，“剎那目擊的利馮慈•阿爾馬克，不，那個人的真實身份是130多年前實施木星探測計劃的成員，菲露特。”皇向菲露特示意到。
“是。”菲露特立刻開始操控面前的終端。
地面上彈出了一副圖片，看上去是兩個人的背影，菲露特開始報告︰“木星載人探測計劃，包含了太陽爐開發計劃，就算存在著利馮慈類型的變革者，也不足為奇。”
隨著菲露特的操控，其中一個人的身影被放大，同時一個詳細的報告單被彈出來，隨後又有更多的圖片彈出來。
“被金屬異星體吞噬了。”剎那判斷道。
“嗯，這樣猜測合乎邏輯。”尼爾說道。
“阿拉，如果是這樣的話真不得了啊。”萊爾也是十分頭疼地不知道想到了什麼。
“根據Veda的情報，地面上也出現相同的受害者。”皇雖然不知道萊爾在想什麼，不過也知道這確實很不得了。
“異星體的目的究竟是什麼呢？”阿雷路亞提出問題。
“不知道，連有沒有意識都不知道。”皇對著問題很苦惱。
“咳咳，提耶利亞快回來了吧，說起來，他說要在今天給咱們驚喜的，不會是今天就回來吧。”李戰突然打破了沉默的氣氛。
“啊，說起來，提耶利亞那家伙居然和Veda合體了，真是的。”尼爾抓了抓頭。
沒錯，提耶利亞還是決定和Veda進行意識同步，由于位于移動那個母艦，所以才做出此決定。畢竟當時沒有多余的人進行操控，只能由提耶利亞和雷杰尼去控制戰艦移動到L2的位置。不過，移動到L2後，提耶利亞也沒有回來，說是要處理一些東西，知道最近才說要給李戰他們一個驚喜。
米蕾娜的影像突然出現在牆壁上的屏幕上，“e探測器有反應，有物體接近本艦，光學望遠鏡最大倍率顯示。”
“聯邦的運輸艦？”萊爾疑惑地說道。
“不對。”剎那立刻否定了。
“歐羅巴。”李戰十分肯定地說道。
所有人都詫異地看了李戰一眼，皇示意道，“米蕾娜。”
“了解，搜索最酷似的船，船籍編號9374……是木星載人探測船，歐羅巴。”
“什麼！”尼爾和萊爾震驚地看著屏幕上的飛船，“不過它不是爆炸了嗎？”
“出動高達。”剎那轉身道。
“明白。”剎那帶著尼爾、萊爾和阿雷路亞、瑪麗出發了。
忘記說了，新制作的獄天使高達也建立了雙駕駛座的設定，兩人分別控制武器和高達機動，當然兩人也可以同時控制武器，雙哈嘍控制機體。不過也因此，所以獄天使高達雙手都裝備上武器，而且在使用狙擊槍的時候雙臂就會使用固定支架對狙擊槍進行固定。
同時，00高達身上的gn太陽爐分別交給了獄天使高達和妖天使高達，所以新建造的獄天使高達和妖天使高達都有雙重太陽爐系統。00Q高達比劇場版完成的快，現在托勒密中就有著一台00Q還有00R，而且兩台機體都進行了全裝備著裝，全刃式00Q高達，七劍型00R－Xn高達。
至于提耶利亞的座機，則增添了新武裝——gnhw/3g，其中最主要增添了兩台無人機sem－閃式。
“托勒密第一第二第三閘門打開。”菲露特的聲音打斷了還在思考的李戰。
說起來，李戰現在坐在艦橋的副首席上，正在觀看眾人操作。哈？你說為什麼不駕駛守護神，那是因為守護神高達被送到外宇宙母艦——天人號上去了，作為一個超高效率的gn引擎使用。
“唉……”李戰嘆了一口氣，剎那駕駛全刃式00Q高達出發了，就連妮娜都駕駛粒子儲存器型七劍00R－Xn高達出發了，只有自己還在寂寞地在艦橋上呆著。
“啊，歐羅巴艦體上出現大量的不明物體，是異星體！！”米蕾娜驚訝地張著小口。
“嘖。”李戰無趣地站到了指揮椅旁邊。
不久後，高達與異星體進行接觸，菲露特報告道，“三分之一的異星體正在靠近獄天使高達，還有一部分接近00Q，其他機體陷入苦戰，等等，00Q脫離戰場。”
“我就知道，看來異星體果然有意識，讓剎那回來，托勒密準備炮擊吧。”李戰說道。
“明白。”菲露特立刻將數據傳輸到剎那那里。
“傳輸完畢，剎那回航中……”
“檢測到守護神高達和另一個未知機體的信號，進入戰場！”米蕾娜突然驚喜地說道。
“嗯？提耶利亞回來了嗎，來的真是時候。”皇松了一口氣。
就連遠在艦橋中的眾人都看到遠處出現了大量的光束粒子，很明顯是守護神的羽翼浮游炮，隨後又是一個大爆炸，看樣子歐羅巴已經被摧毀了。
“高達各機，集中處理飛向地球圈的碎片。”皇又想了想另一台機體，但是沒有任何情報便放棄繼續思考。
啊，說起來之前囚禁的那個里維爾被提耶利亞一同帶到了天人號上進行數據清除了，不知道他是不是跟了過來。李戰想著。
半個小時後，機師休息室中，高達機師們聚集在這里等待著回來的兩個人，李戰也在這里。
穿著藍衣服的兩個人先後將頭盔摘下，露出了相似的外表。
“提耶利亞……呃，兩個提耶利亞？”尼爾和萊爾張大嘴看著兩個樣貌相似的人。
“我是雷杰尼•雷杰塔，同樣是原始變革體。”後面的那個長發的雷杰尼笑了。
“呵呵，我們兩個人擁有相同的基因序列，所以長得比較相像。”前面短發的提耶利亞也是笑著說道。
“不過，看樣子現在不是慶祝重逢的時候。”提耶利亞語氣突然一變。
“剎那，為什麼不攻擊eLs？”提耶利亞轉身問向剎那。
“eLs？”瑪麗疑惑地提了一句。
“聯邦政府對異星體的簡稱，剎那說出不攻擊eLs的理由。”提耶利亞仍在質問著剎那。
“不知道……”剎那的情緒很低落。
“不知道？喂喂，不是吧……”萊爾疑惑地看著剎那。
“果然，身為變革者的直覺讓你這麼做。”雷杰尼走上前來，眾人的目光立刻擊中在提耶利亞兩人身上。
“即便動用Veda的情報系統，eLs的目的仍然是個謎。”雷杰尼繼續說道。
“但是，你從它們的身上感覺到了異樣，無意識間做出了反應，這說明eLs存在意識。”提耶利亞接上話。
“即便如此，它們似乎也不打算和我們溝通啊。”尼爾撓撓頭。
“確實……”提耶利亞也沉默了。
李戰拍拍手，打斷了眾人的思考，“啊，好了各位，提耶利亞和雷杰尼剛回來，讓兩人好好休息吧，房間拉瑟都收拾好了，大家散了吧。”
“也是，不過在那之前我要去艦橋報告。”提耶利亞說道。
“是是是，走吧。”李戰率先離開了。
艦橋內，眾人集結在一起，連宅在房間中的伊歐利亞也出來了。
“異星體……eLs的來訪……”皇喃喃自語著。
“這就是伊歐利亞大叔所說的即將到來的對話嗎……”拉瑟看向伊歐利亞。
“對話倒是沒錯，但是太早了。”伊歐利亞也是眉頭緊皺。
“計劃中，對話指的是人類在進入宇宙後，現在的確太早了。”提耶利亞知道計劃詳情，感到十分不安。
“怎麼會……人類根本毫無準備……”阿雷路亞悲觀的說道。
“現實發生了……只有一戰了。”萊爾說道。
尼爾倒是有些反對，“不對，這樣的話……”
“我也贊成，已經造成實際傷害了。”拉瑟點頭道。
“這種想法太魯莽了。”瑪麗反駁道。
“對啊，也許是eLs對我們缺乏了解，才會發生這些事情。”阿雷路亞立馬支持瑪麗道。
“老伊頭，你怎麼看。”李戰突然看向伊歐利亞。
“都說了，不要叫我老伊頭！！”伊歐利亞立刻跳腳地吼道，隨後才面向眾人嚴肅地說道，“我認為eLs有意識，所以才會襲擊腦量子波高的人，因此，我想要讓可以進行量子爆發的兩人進行對話，可以吧，剎那，李戰。”
“啊，可以。”剎那低沉地回答道。
“在那之前，伊恩，把Veda的小型終端安裝在兩機里面。”李戰對伊恩說道。
“嗯？你想做什麼？”
“gn太陽爐、Veda、變革者，只有當三者合一的時候才能發揮溝通的真正能力。”伊歐利亞說道。
“沒辦法了，在抵達之前，我會盡力的。”伊恩撓撓頭，無奈的說道。
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